PARAMFILE PhD Thesis Marc Baaden 250800 MASS C 12.01 CA 12.01 CT 12.01 CF 12.01 CX 12.01 CZ 12.01 0.878 MX 15.03 MZ 13.02 CP 35.45 LZ 35.45 FZ 35.45 1.910 CS 132.9054 EU 151.96 F 19. H 1.008 HC 1.008 HA 1.008 HO 1.008 HW 1.008 HZ 1.008 0.135 LA 138.91 LI 6.94 IP 22.99 N 14.01 NP 14.01 NX 14.01 O 16. OP 16. OS 16. O2 16. OU 16. OH 16. OW 16. P 30.97 ST 32. U 238.03 YB 173.04 BOND C -CA 469. 1.409 C -CT 317. 1.522 C -N 490. 1.335 C -O 570. 1.229 C -O2 656. 1.25 C -OS 425. 1.338 CA-CA 469. 1.4 CA-CT 317. 1.51 CA-HA 367. 1.08 CA-N 337. 1.41 CA-NA 427. 1.381 CA-OS 300. 1.4 CF-F 400. 1.38 CP-OP 216. 1.758 CT-CT 310. 1.526 CT-F 367. 1.38 CT-HC 340. 1.09 CT-N 337. 1.449 CT-OH 320. 1.41 CT-OS 320. 1.41 CX-NX 500. 1.157 CZ-FZ 216. 1.758 CZ-HZ 331. 1.1 FZ-FZ 100. 2.903 FZ-HZ 100. 2.34 H -N 434. 1.01 HO-OH 553. 0.96 HO-OS 553. 0.96 HW-HW 553. 1.514 MX-CX 500. 1.458 MX-NX 500. 2.615 N -OS 340. 1.21 NP-OH 300. 1.26 NP-OS 300. 1.26 O2-P 525. 1.48 OH-P 230. 1.61 OP-OP 100. 2.903 OS-P 230. 1.61 OW-HW 553. 0.957 P -CA 331. 1.81 P -CT 331. 1.82 ST-CF 400. 1.82 ST-O 400. 1.57 U -OU 300. 1.8 ANGL C -CA-CA 63. 120. C -CA-HA 35. 120. C -CA-N 70. 120. C -CT-CT 63. 111.1 C -CT-HC 50. 109.5 C -CT-N 63. 110.1 C -CT-OS 50. 109.5 C -N -CT 50. 121.9 C -N -H 30. 120. CA-C -CA 63. 120. CA-C -N 70. 120. CA-C -O 70. 120. CA-CA-CA 63. 120. CA-CA-CT 70. 120. CA-CA-HA 35. 120. CA-CA-N 70. 120. CA-CA-OS 70. 120. CA-CT-CA 70. 109.5 CA-CT-CT 63. 114. CA-CT-HC 50. 109.5 CA-N -C 40. 112. CA-N -CA 70. 120. CA-N -H 40. 107. CA-N -OS 70. 118. CA-OS-CT 46.5 113. CA-P -CA 60. 107.2 CA-P -O2 60. 111.8 CF-ST-O 80. 109.5 CT-C -N 70. 116.6 CT-C -O 80. 120.4 CT-C -O2 70. 117. CT-CT-CT 40. 109.5 CT-CT-HC 50. 109.5 CT-CT-N 80. 109.7 CT-CT-OH 50. 109.5 CT-CT-OS 50. 109.5 CT-N -CT 50. 118. CT-N -H 30. 118.04 CT-OH-HO 55. 108.5 CT-OS-CT 60. 109.5 CT-OS-P 100. 120.5 CT-P -CA 60. 106. CT-P -CT 60. 105. CT-P -O2 60. 114.4 F -CF-F 80. 109.5 F -CT-F 77. 109.1 H -N -H 35. 120. HC-CT-HC 35. 109.5 HC-CT-N 50. 109.5 HC-CT-OS 35. 109.5 HC-CT-P 35. 109.5 HO-OH-P 45. 108.5 HW-HW-OW 0. 127.74 HW-OW-HW 100. 104.52 MX-CX-NX 100. 180. N -C -O 80. 122.9 N -CT-CA 70. 120. NP-OH-HO 45. 105.3 O -C -O 80. 126. O -ST-O 80. 109.5 O2-C -O2 80. 126. O2-P -O2 140. 119.9 O2-P -OH 45. 108.23 O2-P -OS 100. 108.23 OH-P -OS 45. 102.6 OP-CP-OP 70. 109.47 OS-CT-P 50. 114. OS-N -OS 80. 124. OS-NP-OH 150. 120. OS-NP-OS 150. 120. OS-P -OS 45. 102.6 OU-U -OU 150. 180. P -CA-CA 40. 120. P -CT-C 60. 112.2 P -OS-P 100. 120.5 ST-CF-F 80. 109.5 X -CF-X 80. 109.5 X -ST-X 80. 109.5 DIHE C -N -CT-C 1 0.2 180. 2. CA-CA-P -CA 6 0. 0. 2. CT-CT-C -N 1 0.1 0. -4. CT-CT-C -N 1 0.07 0. 2. CT-CT-N -C 1 0.5 180. -4. CT-CT-N -C 1 0.15 180. -3. CT-CT-N -C 1 0.53 0. 1. CT-CT-OS-CT 1 0.38 0. -3. CT-CT-OS-CT 1 0.1 180. 2. CT-P -CA-CA 6 0. 0. 2. H -N -C -O 1 2.5 180. -2. H -N -C -O 1 2. 0. 1. N -CT-C -N 1 0.4 180. -4. N -CT-C -N 1 1.35 180. -2. N -CT-C -N 1 0.75 180. 1. O2-P -CA-CA 6 0. 0. 2. OH-CT-CT-OH 1 0.14 0. -3. OH-CT-CT-OH 1 1. 0. 2. OH-P -OS-CT 1 0.25 0. -3. OH-P -OS-CT 1 1.2 0. 2. OS-CT-CT-OH 1 0.14 0. -3. OS-CT-CT-OH 1 1. 0. 2. OS-CT-CT-OS 1 0.14 0. -3. OS-CT-CT-OS 1 1. 0. 2. OS-NP-OH-HO 1 10.2 180. 2. OS-P -OS-CT 1 0.25 0. -3. OS-P -OS-CT 1 1.2 0. 2. X -C -CA-X 4 14.5 180. 2. X -C -CT-X 4 0. 0. 2. X -C -N -X 4 10. 180. 2. X -CA-CA-X 4 14.5 180. 2. X -CA-CT-X 6 0. 0. 2. X -CA-N -X 4 6.8 180. 2. X -CA-NA-X 4 6. 180. 2. X -CA-OS-X 2 2. 180. 2. X -CT-CT-X 9 1.4 0. 3. X -CT-N -X 6 0. 0. 2. X -CT-OH-X 3 0.5 0. 3. X -CT-OS-X 3 1.15 0. 3. X -CT-P -X 9 0. 0. 2. X -OH-P -X 3 0.75 0. 3. X -OS-P -X 3 0.75 0. 3. X -ST-CF-X 3 0. 0. 3. IMPR C -CA-N -CA 20. 180. 2. CA-C -O -N 20. 180. 2. CA-CA-CA-CT 1.1 180. 2. CA-CA-P -CA 20. 180. 2. CA-N -CA-CA 20. 180. 2. CA-N -OS-OS 70. 180. 2. CT-C -O -N 20. 180. 2. N -C -CA-O 20. 180. 2. N -C -O -CA 20. 180. 2. O -C -N -CA 20. 180. 2. O -CA-C -N 20. 180. 2. OS-OH-NP-OS 50. 180. 2. OS-OS-NP-OS 50. 180. 2. X -CA-CA-X 20. 180. 2. X -CT-N -CT 1. 180. 2. X -O2-C -O2 10.5 180. 2. X -X -C -O 10.5 180. 2. X -X -CA-HA 1.1 180. 2. X -X -N -H 1. 180. 2. NONBD SO 1.9980 0.3100 Dimethylsulfoxide C 1.908 0.086 CA 1.908 0.086 CT 1.908 0.1094 CF 2. 0.15 CX 2.048 0.15 CZ 1.914 0.137 MX 2.119 0.207 MZ 2.133 0.08 LZ 1.947 0.3 LZ 1.947 0.3 FZ 1.936 0.275 CS 3.397 0.0001 EU 1.852 0.05 set2 value, use 1.650 0.05 for set1 F 1.75 0.061 H 0.6 0.0157 HC 1.487 0.0157 HA 1.459 0.015 HO 0. 0. HW 0. 0. HZ 1.577 0.02 LA 2.105 0.06 set2 value, use 1.875 0.06 for set1 LI 1.137 0.0183 IP 1.868 0.0028 N 1.824 0.17 NP 1.824 0.17 NX 1.796 0.17 O 1.6612 0.21 OP 1.6 0.2 OS 1.6837 0.17 O2 1.6612 0.21 OU 1.75 0.2 OH 1.721 0.2104 OW 1.7683 0.152 P 2.1 0.2 ST 2. 0.2 U 1.58 0.4 YB 1.656 0.04 set2 value, use 1.475 0.04 for set1